Mayakirjoitus on ollut nykyajan tutkijoille vaikeimpia tulkittavia muinaistekstejä. Alkuaan mayakirjoituksen tulkinta pohjautui kuvakirjoitukseen eli siihen, että kukin merkki tarkoittaisi yhtä käsitettä (keltaiset glyyfit). Uusi lukutapa on foneettinen: merkeistä etsitään sellaisia lisäkkeitä, jotka tarkoittaisivat äänteitä ja tavuja (punaiset glyyfit). Vanhaa tulkintaa ei ole täysin hylätty, mutta uuden lukutavan ansiosta teksteistä on löydetty uusia vivahteita. Esimerkiksi syntymää tarkoittavassa merkissä on kaksi foneettista lisäkettä, jotka muuttavat merkityksen muotoon 'on syntynyt'.